El Programa funda su ejecución en cuatro líneas de acción: Jurídico Financiera, Política, Pedagógica y de Internacionalización, para cada una de las cuales tiene definidos manuales de apoyo. Por esta razón los logros que a continuación se presentan, se organizan en dichas líneas:
- Línea de acción jurídico financiera
Esta línea tiene como objetivo realizar el seguimiento a la ejecución del plan de acción y al presupuesto respectivo, de acuerdo con los manuales de apoyo a la ejecución del programa Ondas, así como aportar los recursos financieros, técnicos, jurídico-administrativos y pedagógicos necesarios para la operación del programa, de acuerdo con las pautas generales del flujo de los recursos de origen público.
- Línea de acción política
La línea de acción política tiene como propósito brindar las condiciones que garanticen la continuidad y el crecimiento del programa Ondas en cada uno de los entes territoriales. En esa medida, sus actividades están dirigidas tanto a la profundización en el sistema educativo colombiano, como a la ampliación de la cobertura, dos de los programas del plan de acción en el ámbito nacional, acordes con el cumplimiento de los objetivos de Ondas.
- Línea de acción pedagógica
La línea de acción pedagógica está estructurada desde los diferentes momentos de la Investigación como Estrategia Pedagógica (IEP), en los cuales se concretan sus 9 componentes que son: formación, organización, sistematización, comunicación, acompañamiento, virtualización, evaluación, ambiente y buen vivir y evaluación, los cuales son transversales a todo el quehacer del programa Ondas.
- Línea de acción de internacionalización
La internacionalización en Colciencias tiene como objetivo general propiciar el posicionamiento de la Ciencia, la Tecnología y la Innovación CT+I colombiana en los contextos internacionales, y facilitar el acceso de los grupos y centros de investigación y desarrollo colombianos a los conocimientos estratégicos.
- Línea de acción editorial
Esta línea tiene como propósito general definir y unificar los lineamientos editoriales de las publicaciones en formato impreso, digital y audiovisual del programa Ondas. Así como definir el diseño y la elaboración de los materiales pedagógicos y de apropiación y divulgación del programa Ondas.
- Aprendizajes
Las dinámicas del Programa buscan articular diferentes tipos de aprendizaje en un proceso de negociación cultural y diálogo de saberes, las cuales hacen reales la existencia de las comunidades prácticas de producción de saber y conocimiento Ondas como se ve a continuación: