La vicerrectoría académica de la universidad de conformidad a sus orientaciones misionales establece mecanismos para promover el desarrollo de la docencia y la investigación en la diversidad ecosistémica y cultural del Chocó Biogeográfico, el uso y el manejo de los recursos naturales con el propósito de generar criterios científicos que permitan contribuir al desarrollo social y económico de la región.
Desde allí se realizan esfuerzos para transformar la academia, procurando la pertinencia y relevancia de la educación tendiente a transformar, con énfasis en la enseñanza para dar paso a la educación centrada en el aprendizaje; en este sentido procura una educación mas significativa que privilegie la formación por competencias y por ende desarrolle nuevas tecnologías metodologías que permitan un dinamismo y pro actividad de los procesos académicos que redunden en la formación integral de los profesionales.
Desde sus ejes misionales

Desarrolla el plan de acreditación, sistema de autoevaluación y acreditación cuyo objetivo es consolidar el sistema general de autoevaluación y aseguramiento de la calidad y la acreditación institucional sentando las bases para la acreditación institucional.
Plan de desarrollo de la docencia: Selección y vinculación de los docentes, consolidando procesos transparente de evaluación objetiva, fomentando la formación en maestría y doctorados, el aprendizaje de un segundo idioma, educación continuada.
Fortalecimiento del pregrado y renovación curricular: Actualizando y flexibilizando el currículo revisando permanentemente las estructuras curriculares, evaluación permanente del modelo pedagógico , fomento de la investigación formativa.
A nivel de administración académica: Mejoramiento de los procesos de organización de cursos, dirección académica y atención a estudiantes de las facultades y programas académicos.

Creación de nuevos programas académicos con pertinencia departamental y regional, diversificación de jornadas de estudio, formación por ciclos propedéuticos, CERES, sedes regionales.

El sistema de evaluación institucional, se afianza en la universidad tecnológica del chocó a partir de desarrollo de la reforma académica “ luces de excelencia” y tiene su asidero en el artículo 55 de la Ley 30 que se expresa así: “ Artículo 55 – La autoevaluación institucional es una tarea permanente de las IES y hará parte del proceso de acreditación”.

En el marco de los procesos de calidad y normatividad vigente, se estructura en la Universidad en macrosistema académico, conformado por el suprasistema de gestión de calidad y la red de facultades; el sistema de gestión de calidad esta conformado por el sistema de regulación, desarrollo, sistema de calidad y evaluación ( MECI).

El sistema de evaluación tiene entre sus funciones el proceso de seguimiento para el registro y acreditación de los programas académicos y la evaluación de los actores institucionales.

Nuestro objetivo es  fortalecer los procesos de autoevaluación con miras a la acreditación de calidad progresiva de programas y la acreditación institucional.

En la actualidad se esta ejecutando con el acompañamiento de la Universidad Tecnológica de Pereira, encontrándose ya elaborado el diagnostico institucional, el modelo de acreditación.

La Vicerrectoría académica se encuentra ubicada en la Ciudadela Universitaria, Bloque 1, tercer piso Oficina 308